Pada tanggal 25 Januari 2021, ISI Yogyakarta melaksanakan penandatanganan MoU dengan Museum Affandi Yogyakarta. Dalam penandatanganan MoU, pihak ISI Yogyakarta diwakili oleh Prof. Dr. M. Agus Burhan, M.Hum. selaku Rektor, dan Helfi Dirix, selaku Kepala Museum Affandi. Penandatanganan MoU dilakukan untuk melandasi aktivitas kerjasama kedua institusi dalam bidang pendidikan, penelitian dan pengabdian kepada masyarakat. Penandatanganan MoU ini dilaksanakan secara desk to desk karena mempertimbangkan faktor kesehatan dan keselamatan di era pandemi Covid-19.